陈村四面环水，河涌交错，支流众多，“折折清江曲入村”，但都属珠江三角洲河网。境内共有四条河流经过，但皆属北江支流。现对主要河道略作介绍：

    东平水道：地处陈村北部，属陈村镇与南海区界河，起于登洲西头至南海林岳西隆。总长度5．38公里，平均阔度95米。疏浚后，已成为广州内河航运走西北江各埠的水道。
    潭洲水道：地处陈村南面，起于登洲头至北滘镇的西海，属陈村镇与北滘镇的一半界河。总长度16.75公 里，平均阔度250米。
    陈村涌：地处陈村东南，起于金字沙至勒竹四方磨接任陈村水道，总长6．8公里，平均阔度120米多。
    陈村水道：地处陈村东面，起于南海南社至西海，中间一段是勒竹与番禺钟村镇围涌的界河，属广州内河航船经顺德、中山，江门、三埠以及西北江各埠的主要水道。总长度11．9公里，平均阔度230公尺。横江头分洪水道(文海河)：起于潭洲水道横江头水闸口至勒竹联安围水闸口交陈村水道，总长度9．6公里。
    横江头昔日有横江渡口，乾隆年间诗人黎二樵曾有：蒹葭夕日远，蟋蟀野塘凉。馀霞云轮赤，立秋禾露香。地宽乔木短，江影木帆长。谁信故乡外，扁舟望故乡。从诗歌可知，当年横江头河面宽阔，一望难尽。
    此外，陈村还有新栏河、新旧圩大河、屯教大河、弼教大河、文登河等，共同构成陈村河网交错，发达的水上交通。